由于世贸协议要求我国农产品平均关税在2004年以前降至17％，对美国进口的农产品降至14．5％，同时取消对美国小麦、肉类、柑橘的进口禁令。这样，以经营农副产品为主的上市公司，如以粮食蔬果种植、加工、经营为主的丰乐种业、金果实业、嘉禾股份、亚盛集团、金健米业等，以肉、奶制品加工为主的如意集团、草原兴发、伊利股份等，将面临不同程度的考验。从1998年报看，农业板块依然是表现良好的上市公司群体，但由于近年来国内外农产品价格下滑，部分公司经营日见困难，而且由于大部分公司资产规模过小，难以形成规模优势，抵御风险的能力较低，利润增幅有减缓的趋势。当然，对于以粮食蔬果加工、经营为主要业务的农业上市公司来说，由于在品种、需求等方面与进口产品存在于不同的市场中，外国产品涌入所造成的影响是有限的。反过来如果抓住加入世贸组织对我国在茶叶、麻等优势产品出口上所带来的有利时机，积极调整经营方向，这将为农业上市公司带来新的机遇。
